大豆LEA基因家族全基因组鉴定、分类和表达

摘要：

”目的”鉴定大豆全基因组中的LEA家族基因,对其进行定位、分类以及组织表达分析,为植物LEA基因的功能研究与利用提供基础.”方法”利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定并获得大豆LEA家族基因的全序列、定位和拷贝数信息；通过序列比对进行进化和分类分析；利用大豆发育表达芯片数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析.”结果”系统地分析鉴定了36个大豆的LEA家族基因,根据结构域的差异和系统发育分析将这些LEA基因分成8个亚家族.基因定位分析结果表明,这些基因分布于大豆的16条染色体上,启动子分析表明,几乎全部LEA基因的启动子区含有逆境反应顺式作用元件.各个发育阶段表达谱的分析结果表明,多数成员至少在一个组织中表达,1 0个差异表达的基因中有5个在种子发育时期优势表达,另外5个在其它部位优势表达.”结论”通过全基因组扫描,获得大豆基因组的36个LEA家族基因,它们分属于8个不同的亚家族,分布于16条大豆染色体上,启动子区含有逆境相关顺式作用元件,基因表达具有一定特异性.

关键词：LEA基因家族、全基因组鉴定、进化分析、差异表达基因

所属期刊栏目：44

分类号：S565.1(经济作物)

在线出版日期：2012-02-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3945-3954