小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A单核苷酸多态性分析及其定位

摘要：

[目的]小麦果聚糖合成酶基因6-SFT是果聚糖合成过程中的关键酶基因,研究6-SFT-A的多态性,分析其与小麦苗期抗旱性的关系,并进行遗传定位.[方法]以苗期抗旱性不同的30份六倍体小麦和4份小麦A基因组供体种乌拉尔图小麦为材料,通过直接测序分析6-SFT-A的单核苷酸多态性(SNP)及其与抗旱性的关系;开发基因分子标记,利用RIL群体(偃展1号×内乡188)对该基因进行遗传定位.[结果]在30份六倍体小麦材料中检测到14个核苷酸多态性位点,包括13个SNP和1个InDe1,平均234 bp检测到一个多态性位点,仅在1 727和1 781 bp 2个位点检测到非同义突变;在4份乌拉尔图小麦中检测到28个SNP和4个InDel,其频率明显高于普通小麦.该基因的内含子1、2、3和外显子3为变异富集区,其它区域变异较小,外显子2变异最小,π值为0.34份材料分为3种单倍型,Hap1 I主要包括中等抗旱材料和水敏感材料,Hap1Ⅲ中主要包括强抗旱材料和中等抗旱材料.利用RIL群体将该基因定位于染色体4A的标记Xcwm-27与Xwpt688之间,遗传距离分别为5.3和7.9 cM.[结论]单倍型分析表明,小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-A单倍型与小麦苗期抗旱性有一定的相关性.

关键词：小麦、6-SFT-A、单核苷酸多态性、抗旱性、单倍型、遗传作图

所属期刊栏目：44

分类号：S512.1(禾谷类作物)

资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）;CGIAR挑战计划

在线出版日期：2011-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2216-2224