中国荷斯坦牛HSF1基因microRNA SNPs与耐热性能的相关性研究

摘要：

[目的]分析638头中国荷斯坦牛HSF1基因多态性与耐热性的关系,以期为中国耐热奶牛分子育种提供参考依据.[方法]设计引物扩增HSF1基因,通过DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术筛查SNPs并分型,利用miRBASE数据库定位microRNA SNPs,利用SHEsis软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型构建,利用SAS软件对不同基因型和单倍型组合个体耐热指标包括红细胞钾浓度、产奶量下降率、直肠温度和耐热系数进行相关分析.应用荧光定量RT-PCR技术研究热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平.[结果]发现2个microRNA种子序列新SNPs,T909C和G4693T.其中909位碱基距离microRNA种子序列5'端3 bp,4 693位突变直接使microRNA种子序列破坏.909位点CC、CT基因型奶牛耐热性能显著高于TT基因型(P<0.05);4693位点TT基因型奶牛耐热性能显著高于GG基因型(P<0.05).共构建出4种单倍型、发现10种单倍型组合.其中H2H4单倍型组合红细胞钾浓度和直肠温度显著低于H1H3单倍型组合(P<0.05),耐热系数显著高于H1H3组合(P<0.05),H2H4组合个体产奶量下降率显著低于H1H1组合个体(P<0.05),H2H4为耐热单倍型组合.热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平在不同组织中存在差异,在心脏中最高,是肌肉中的11.24倍(P<0.05).[结论] HSF1基因microRNA SNPs可作为奶牛抗热应激的候选分子标记应用于育种实践.

关键词：中国荷斯坦牛、HSF1、耐热性能、microRNA、多态性

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分类号：S8(畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂)

资助基金：国家高技术研究发展计划（863计划）;现代农业产业技术体系建设项目;公益性行业科研专项;山东省自然科学基金;山东省农业良种工程项目

在线出版日期：2011-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：570-578