琯溪蜜柚BAC文库的构建和汁胞粒化相关基因的筛选

摘要：

”目的”构建琯溪蜜柚BAC文库,利用该文库筛选与汁胞粒化相关的基因.”方法”用温和的物理方法获得高分子量DNA,部分酶切后进行回收、连接、转化,超低温保存阳性克隆.构建DNA样品混合样,PCR法筛选文库,生物信息学分析DNA序列.”结果”改进了适合琯溪蜜柚BAC文库构建的方法;构建的琯溪蜜柚BAC文库含有26 112个单克隆,空载率小于1%,叶绿体DNA的污染率不超过1%,插入片段平均大小大约120 kb,覆盖8倍的琯溪蜜柚基因组.利用与琯溪蜜柚汁胞粒化相关的EST序列设计PCR引物筛选文库,得到一段大小为1 088 bp的DNA序列,该序列含有两段大小分别为122 bp和172 bp的内含子,经同源比对发现,该序列中部分序列与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)多铜氧化酶(multicopper oxidase)cDNA序列分别有85%和71%的同源性;与毛叶番荔枝(Annona cherimola)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)果胶酯酶(pectinesterase)cDNA序列分别有76%和73%的同源性.”结论”本研究构建的BAC文库适用于琯溪蜜柚功能基因组的研究,从BAC文库筛选获得的DNA序列与汁胞粒化相关的基因有高度同源性.

关键词：琯溪蜜柚、BAC文库、粒化、文库筛选

所属期刊栏目：43

分类号：S6(园艺)

资助基金：国家科技支撑汁划项目2007BAD07B01;福建省重大专项前期项目2005NZ1003

在线出版日期：2010-11-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：3791-3797