利用SSH技术鉴定黄瓜胚胎发育相关基因

摘要：

”目的”寻找黄瓜胚胎发育早期和胚胎发育晚期优势表达基因,研究其胚胎发育的分子机制.”方法”利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建胚胎发育早期和晚期差异表达cDNA文库.”结果”经反向Northern blot杂交检测,共得到97个阳性克隆.利用分子生物学软件对测序后的序列进行质量检测和聚类、拼接,共得到93个UniESTs,其中包括86个Singletons和7个contigs.将上述EST序列在GenBank上进行BLAST比对,有83个EST片段找到了与之匹配的同源序列,有10个EST片段未找到同源序列,推测可能是新基因.”结论”其中很多EST与拟南芥、水稻或玉米蛋白质数据库中的热激蛋白具有很高的同源性.将以上序列应用Geneontology进行功能分类,发现在胚胎发育早期细胞防御和代谢过程占主要位置;在胚胎发育晚期细胞防御和抗渗透胁迫功能是非常重要的.

关键词：黄瓜、SSH、胚胎发育、cDNA文库

所属期刊栏目：43

分类号：S6(园艺)

资助基金：国家”863”计划项目2006AA100108-4;哈尔滨市科技创新人才资金项目008RFXXN002

在线出版日期：2010-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：2292-2299