小菜粉蝶颗粒体病毒lef-3基因的克隆与分析

摘要：

”目的”研究杆状病毒lef-3基因的起源与进化,从分子水平明确病毒之间的亲缘关系.”方法”通过常规PCR方法获得小菜粉蝶颗粒体病毒晚期基因表达调控因子,lef-3的基因片段,克隆后测序,然后利用软件对lef-3及编码序列进行生物信息学分析.”结果”克隆得到的PiraGV lef-3基因ORF序列中存在4个突变位点,但氨基酸性质未发生改交,推导PiraGV LEF-3蛋白含399个氨基酸残基,分子量为3.99 kD;通过高级结构预测及其编码序列与其它杆状病毒的LEF-3同源性比对表明,该基因可能编码单链DNA结合蛋白;BLAST比对发现lef-3基因只存在于鳞翅目昆虫为宿主的杆状病毒基因组;进化分析表明LEF-3可分为3组,其中GV属的LEF-3聚类为1个组,NPV属的LEF-3聚类为2个组;GV的lef-3基因编码区的选择压力分析表明,大多数lef-3基因间相比较表现为负向选择,但不同lef-3基因问的Ka/Ks不同,也有正向选择;起源分析表明,杆状病毒lef-3基因可能来源于细菌.”结论”获得了小菜粉蝶颗粒体病毒(PiraGV)lef-3基因,通过生物信息学分析推测出了lef-3基因的起源进化规律.

关键词：小菜粉蝶颗粒体病毒、晚期基因表达调控因子LEF-3、单链DNA结合蛋白、进化起源

所属期刊栏目：42

分类号：S4(植物保护)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2006AA10A118

在线出版日期：2010-01-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：4411-4419