鸡传染性支气管炎病毒中国分离株LH2/01/10纤突蛋白基因的遗传变异

摘要：

对传染性支气管炎病毒LH2/01/10的S1和S2基因分别进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定.结果表明,其S基因由3 495个核苷酸组成,编码的多肽由1164个氨基酸残基组成.S蛋白的切割识别位点氨基酸组成为组氨酸-精氨酸-精氨酸-精氨酸-精氨酸(HRRRR).推测其裂解后形成的S1和S2亚单位中,S1由539个氨基酸残基组成,S2由625个氨基酸残基组成.序列分析发现:LH2/01/10与Beau、M41、CU-T2、D1466、DE072、Holte、Gray、Ark99、Conn、H52、KB8523、SD/97/02、ZJ971和LX4毒株S基因推导的氨基酸同源性在63%～96%之间.其中与国内分离毒株SD/97/02和LX4氨基酸的同源性均在95%以上,三者切割识别位点也相同.但与另一国内分离株ZJ971氨基酸的同源性仅为75%,而与国外毒株之间在83%以下.切割识别位点也与ZJ971和所选的国外参考毒株代表性的RRF/SfRR位点不同.与这些参考毒株相比,LH2/01/10 S基因在76～78位缺失TCT碱基,在67～69位插入TCT碱基,105位和549位氨的基酸发生点突变.总体来看,SD/97/02的S1基因推导的氨基酸序列与国内外已报道的42株参考毒株同源性较低,在52%～96%之间.与国内分离毒株亲缘关系相对较近,其中与国内近年来不同地区分离的A2、LX4、SD/97/02、TJ/96/02、JX/99/01、SAIBWJ和Z等毒株在进化树分析中属于同一亚群,氨基酸同源性也在81%以上.与H120等疫苗株的氨基酸同源性在7 5%以下,同源性较低.在S1基因编码蛋白的3个高变区和6个抗原表位内,LH2/01/10与该亚群内的致肾脏病变型毒株同源性均较高.由此可见,LH2/01/10与国内分离的毒株具有较近的亲缘关系,与疫苗株H120 S1基因的低同源性以及LH2/01/10 S基因本身的缺失、插入和点突变造成的变异可能是导致该毒株在IBV H120疫苗免疫鸡群中致病的主要原因.

关键词：传染性支气管炎病毒、纤突蛋白基因、遗传变异

所属期刊栏目：37

分类号：S831(家禽)

资助基金：黑龙江省博士后科研启动基金LRB-KY01045

在线出版日期：2004-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：306-312