大豆抗旱遗传位点及候选基因发掘
叶绿素是植物光合作用必需色素,干旱胁迫可影响其合成并降低光合效率,进而影响大豆产量.为发掘有关大豆干旱胁迫叶绿素含量遗传位点,以199份大豆品种资源构建的自然群体为材料,测定其干旱及正常条件下的叶绿素含量,计算抗旱指数(drought resistance index,DRI),并依据抗旱指数和20×重测序基因型进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).结果表明,共定位到237个显著关联单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)标记(划分为18个位点),分别位于1、2、3、7、10、16、17及18号染色体.在16号染色体关联到181个SNPs,占总SNPs的76.37%,属热点区域,其中9个位于基因内含子区,17个位于外显子区,11个位于上游,10个位于下游,1个位于3'UTR.基于显著关联SNPs获得57个基因,依据基因注释、DNA水平SNP等位变异、RNA水平表达模式,对57个基因进行分析,筛选出3个与大豆抗旱指数相关基因,其中Glyma.16G063600编码F-box蛋白,Glyma.10G007000编码AP2-EREBP转录因子,Glyma.17G143900编码AP2/ERF结构域蛋白.以上研究结果为大豆抗旱育种奠定理论基础.
大豆、叶绿素含量、干旱胁迫、全基因组关联分析
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S565.1(经济作物)
现代农业科技奖励性后补助资金项目;河北省现代农业产业技术体系创新团队项目
2023-10-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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