陆地棉GELP家族基因鉴定及其响应胁迫的表达分析

摘要：

GELP型脂肪酶(GDSL-type esterase/lipase proteins,GELPs)是一类N端含有GDSL-motif的脂质水解酶,在植物生长发育、应激反应及病原菌防御中均发挥非常重要的作用.基于最新发布的陆地棉基因组数据,从全基因组水平上鉴定出210个陆地棉GELP基因,根据系统发育关系将其分为10个亚家族(A～J).这些GhGELP基因不均匀地分布在26条染色体上,且主要分布在染色体两端.基因结构分析表明,高达66.7％的GhGELP基因被4个内含子打断,其编码区域由5个外显子组成.分析发现,GhGELP基因启动子区域共存在7种激素和逆境胁迫响应元件.最后,利用RNA-seq数据研究了GhGELP基因在黄萎病菌和多种非生物胁迫处理下的表达谱.表达分析显示,大多数GhGELP基因响应黄萎病菌诱导后表达量下调,受非生物胁迫诱导后亦呈下调表达趋势,且一些成员可同时响应多种非生物胁迫.对棉花GELP基因家族进行了鉴定和分析,为后续研究其功能提供了一定的理论依据.

关键词：陆地棉;GELP基因家族;基因鉴定;系统发育分析;胁迫响应

所属期刊栏目：24

分类号：S562;Q78(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金;现代农业产业技术体系;河北省杰出青年科学基金项目

在线出版日期：2022-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：93-103