高通量测序分析蚕豆种子内生细菌的多样性

摘要：

为了分析蚕豆种子内生细菌的多样性,采用Illumina MiSeq高通量测序技术,从日本大白皮(S18P23.1、S18P23.2)和启豆2号(S18P24.1、S18P24.2)的种子获得16S RNA V3～V4区有效序列133 855条.将高于97％相似度的序列划分为一个操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU),优化后得到1 598个OTUs.内生细菌种群分析结果表明,拟杆菌门(Bacteroidetes,丰度为30％～33％)、变形菌门(Proteobacteria,23％～25％)、厚壁菌门(Firmicutes,23％～25％)和放线菌门(Actinobacteria,5％～7％)为两个蚕豆品种共有的优势菌门,但属水平的优势菌群在供试蚕豆种子中均有差异.这些结果表明,蚕豆种子具有丰富的内生细菌资源,含有多种具有益功能性状的细菌类群,值得进一步跟踪研究这些益生菌在蚕豆种植到土壤后的变化规律;启豆2号种子中益生菌的种类和丰度高于日本大白皮,值得进一步分离和研究这些益生菌的益生或促生特性,筛选获得在食品和生物肥料等领域有应用潜力的菌株.

关键词：高通量测序、蚕豆、内生细菌、多样性

所属期刊栏目：23

分类号：S664.143.6(果树园艺)

资助基金：国家食用豆产业技术体系项目;青岛市农业科学研究院院长基金项目

在线出版日期：2021-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：73-80