棉花WRKY转录因子家族成员的鉴定和生物信息学分析

摘要：

WRKY转录因子家族在植物抵御各种生物、非生物胁迫反应和生长发育调控中扮演着重要角色.利用生物信息学方法鉴定和分析棉花A基因组WRKY转录因子,共鉴定得到109个候选WRKY基因,编码区全长474～3 528 bp,基因分布在棉花13条染色体上.依据WRKY家族基因的保守结构域和系统进化关系,将其划分为3个大组:G1组、G2组和G3组.G1组WRKY基因包括21个成员,其中18个含有两个WRKY域;G2组有73个成员,可进一步分为G2-a、G2-b、G2-c、G2-d和G2-e五个亚类;G3组WRKY基因包括15个成员.同组的WRKY成员保守域的氨基酸构成大体相似,但也存在WRKYGQK多肽和锌指结构的变异,不同组成员的氨基酸保守域组成特异.拟南芥和棉花WRKY基因的系统进化树表明,功能相似的基因聚在一起,暗示和拟南芥抗逆功能基因聚类在一起GaWRKY可能参与棉花抵御逆境胁迫反应,为进一步发现和挖掘棉花WRKY基因的功能奠定理论基础.

关键词：棉花、WRKY、鉴定、进化分析

所属期刊栏目：19

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：河北省自然科学基金;河北大学自然科学研究项目

在线出版日期：2017-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：9-15