固氮施氏假单胞菌全局性调控因子RsmA的进化分析及表达特性研究

摘要：

RsmA是假单胞菌属高度保守的全局性调控因子,该蛋白可通过与靶基因的mRNA结合影响其稳定性或者抑制靶基因的翻译影响蛋白表达.固氮施氏假单胞菌A1501中发现一个rsmA同源基因及一个可能参与rsmA活性调节的非编码小RNA rsmZ基因.对A1501菌中RsmA及RsmZ的分子进化及表达特性进行了研究.分析结果表明,RsmA与铜绿假单胞菌同源性可达98％,RsmZ具有4个RsmA的结合位点.实时定量RT-PCR结果显示,rsmA在生长初期具有高表达量,而在指数生长期以及平台稳定期表达量下降.非编码RNA rsmZ的转录水平在整个生长时期未发生显著变化.在碳匮乏条件下,rsmA和rsmZ的表达量都显著下调.在一般胁迫σ因子rpoS突变株中,rsmA的表达未受影响,但rsmZ表达上调了30多倍,说明rsmZ的表达受rpoS的负调控.进一步发现,A1501菌中,rsmA和rsmZ的转录不受转录调控因子gacA突变的影响,这与荧光假单胞菌CHAO和铜绿假单胞菌PAO1的调控模式区别,表明RsmA的转录调控模式在固氮施氏假单胞菌A1501中有其独特性.该结果为进一步探索固氮施氏假单胞中RsmA的功能及其特定条件下的调控机制奠定了理论基础.

关键词：施氏假单胞菌A1501、生物固氮、rsmA、rsmZ、转录调控

所属期刊栏目：16

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

在线出版日期：2014-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：62-69