大豆LIM转录因子家族鉴定及盐胁迫响应分析

摘要：

为探究大豆LIM转录因子家族基因在应答盐胁迫中的功能,利用生物信息学方法,根据大豆全基因组数据,共鉴定出21个LIM基因,命名为GmLIM01～GmLIM21,分析大豆LIM基因家族的染色体位置、蛋白质的理化性质、进化关系、保守基序以及对非生物逆境胁迫的响应.结果表明,这些GmLIM基因在大豆20条染色体中的14条染色体上分布不均,片段重复是大豆LIM家族扩大的主要原因.根据系统发育进化分析,大豆21个LIM基因可分为5个亚家族,与其他9个物种的LIM基因一起构建进化树,也可分为5个亚家族.大豆的21个GmLIM基因共包含10个基序,大部分LIM蛋白含有motif1、motif 2和motif 4这3个保守基序.此外,顺式调控元件的分析表明,在GmLIM基因的启动子序列中,与光响应、生长发育、植物激素和非生物逆境胁迫应答相关的调控元件非常丰富.定量PCR结果表明,在盐胁迫处理后大豆叶和根中GmLIM07、GmLIM17基因的表达量分别在3和6 h达到峰值,后随着处理时间的加长表达量下降.综上GmLIM基因在大豆的盐胁迫应答过程中具有重要的调控作用.

关键词：大豆、LIM基因、生物信息学、盐胁迫、基因表达模式

所属期刊栏目：28

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：山西农业大学省部共建有机旱作农业国家重点实验室自主研发项目;山西省自然科学基金;山西省自然科学基金;山西农业大学育种工程;山西农业大学农学院育种工程重点培育专项

在线出版日期：2023-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共15页

页码：26-40