绒山羊胚胎期次级毛囊发生发育相关miRNA的筛选及靶基因验证

摘要：

为筛选绒山羊次级毛囊发生发育相关microRNA(miRNA)及靶基因验证,本研究基于课题组前期高通量测序技术得到绒山羊胎儿期(45、55、65、75、95、115和135 d)皮肤组织miRNA表达谱的基础上,鉴定各比对组中差异表达的miRNA并根据毛囊形态发生规律筛选次级毛囊发生发育相关的miRNA,运用RNAhybrid、miRanda和TargetScan软件预测筛选到的miRNA靶基因并与次级毛囊发育相关基因取交集,所得基因进行GO和KEGG富集分析,筛选毛囊发生发育重要通路中的关键基因构建miRNA-mRNA调控网络,进而运用双荧光素酶报告验证关键miRNA-mRNA的靶向关系.结果表明:1)筛选到次级毛囊发生发育相关miRNA 153个,共预测到32 978个靶基因;2)取交集后得到1 352个靶向的次级毛囊发生发育相关的基因,且显著富集在29条KEGG通路中,其中毛囊发生发育重要通路TGF-β同样显著富集;3)构建了 chi-miR-26b-5p-SMAD1和chi-miR-495-3p-SMAD1等232对次级毛囊发生发育可能相关的miRNA-mRNA关系对,双荧光素酶报告系统进一步验证了关键靶向关系.本研究为解析miRNA在绒山羊次级毛囊发育过程中的分子机制奠定了前期基础.

关键词：关健词 绒山羊、次级毛囊、miRNA、靶基因

所属期刊栏目：28

分类号：S827(家畜)

资助基金：国家重点研发计划;内蒙古自治区科技重大专项项目;研究生科研创新项目

在线出版日期：2023-02-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：90-103