静原鸡胸肌与腿肌肌苷酸特异性沉积相关基因的生物信息学分析

摘要：

旨在筛选影响静原鸡胸肌与腿肌中肌苷酸(Inosine monphosphate,IMP)特异性沉积相关关键差异蛋白.基于课题组前期利用高效液相色谱法测定IMP和肌苷含量,并且采用液相色谱-质谱(LC-MS/MS)技术对选取的具有相同遗传背景180日龄静原鸡胸肌和腿肌进行蛋白质组测序,本研究运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术对相关基因进行表达量分析,并利用蛋白质组测序数据筛选出IMP合成相关关键差异表达蛋白,对其进行生物信息学分析,以及差异表达蛋白对应基因与IMP相关性分析.结果表明:1)差异蛋白对应基因表达量与蛋白质组测序数据结果一致.2)通过KEGG通路富集分析发现,嘌呤代谢通路中筛选出差异表达蛋白PKM2和PGM1.3)同时对差异表达蛋白PKM2和PGM1参与的GO功能富集分析显示,PKM2主要参与ADP产生ATP、嘌呤核苷代谢和糖酵解等生物学过程,细胞内的细胞器和细胞质等细胞组分,镁离子结合、丙酮酸激酶活性和磷酸转移酶活性等分子功能;PGM1参与碳水化合物代谢和有机物代谢等生物学过程,其分子功能涉及镁离子结合和异构酶活性等.4)蛋白网络互作分析进一步发现,PKM2与ENO4、GAPDH等11个蛋白相互作用,PGM1 与PGM2、TKT等10个蛋白相互作用.5)PKM2和PGM1与静原鸡胸肌和腿肌IMP的相关性分析显示,胸肌PKM2 mRNA表达量与IMP含量呈负相关性(r=-0.171 0),但腿肌PKM2mRNA表达量与IMP含量呈极显著正相关(r=0.735 0)(P＜0.01);胸肌和腿肌PGM mRNA表达量与IMP含量均呈极显著负相关(r=-0.536 2和-0.512 5)(P＜0.01).本研究为提高静原鸡肉风味,促进地方品种资源的开发利用提供科学依据.

关键词：静原鸡、胸肌、腿肌、肌苷酸、蛋白质组学

所属期刊栏目：27

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：宁夏自然科学基金项目2021AAC03001

在线出版日期：2022-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：227-239