光控和埋置褪黑激素促进绒山羊长绒的皮肤毛囊差异表达基因网络分析

摘要：

为研究光控增绒和埋置褪黑激素促进绒山羊在非产绒季节(5-8月份)长绒的皮肤毛囊差异表达基因之间的互作关系,并筛选出皮肤毛囊发育相关的重要功能基因,以Agilent绵羊的全基因组表达谱芯片杂交获得的光控增绒羊皮肤差异表达的99个基因及埋置褪黑激素绒山羊皮肤差异表达的83个基因作为研究对象,结合NCBI数据库,利用RStudio程序包和Cytoscape 3.3.0构建差异基因网络并分析.光控增绒试验组差异基因构建了1个主网络和4个小网络;对照组差异基因构建了1个主网络和5个小网络.与表达量结合分析基因网络发现,K25、KAP16-2基因上调促进ISG1 7、RSRP1、GIMAP1和CYTIP基因的下调,间接促进TNFAIP6基因的下调;CYP17A1、V15和K2-12(K85)基因的上调促进ddit3基因的下调;KAP16-3基因促进CYP17A1基因的同时抑制CYP1A1基因.埋置褪黑激素试验组差异基因构建了2个主网络和7个小网络,对照组差异基因构建了3个主网络和1个小网络.与表达量结合分析基因网络发现,CTNNB1基因的上调促进COL3A1基因的下调;FLT-1基因的上调促进CGA基因的上调和COL1A2基因的下调;PAX6基因的上调促进DOK4基因的上调和LOC101110099基因的下调;P450基因的上调促进BLG基因的下调.光控增绒羊皮肤中筛选出来的基因中角蛋白、角蛋白关联蛋白、CYP17A1、SP-D等23个显著上调基因和CYP1A1、COL6A5、LOC100101238、ddit3等13个显著下调基因对光控增绒羊皮肤毛囊提前进入兴盛期有重要作用;埋置褪黑激素的绒山羊皮肤中筛选出来的基因中CTNNB1、PAX6、DOK4、LOC105602529等13个显著上调基因和酪蛋白家族、胶原蛋白类、LOC101110099等12个显著下调基因之间的信号传导增强,从而促进绒山羊绒毛进入兴盛期.

关键词：绒山羊、光控增绒、褪黑激素、差异表达基因、网络分析

所属期刊栏目：22

分类号：S826.9(家畜)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31260545;国家公益性行业农业科研专项201303059;内蒙古自治区自然科学基金资助项目2014BS0333;内蒙古自治区创新基金项目2013CXJJM03;内蒙古自治区科技创新引导项目;国家自然科学基金项目31402052;内蒙古自然科学基金博士项目2014BS0313;内蒙古民族大学科学研究项目BS308

在线出版日期：2017-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：45-54