苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析

摘要：

通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析.其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2U、Mg2+ 1.5 mmol/L、DNA模板75 ng、引物0.5μmol/L.从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析.结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polymorphism information content,PIC)值在0.66～0.95,每对引物组合扩增位点为7～13个,多态性比率平均值为81.6％,其中多态性信息量值为0.95的引物组合为me7em11、me9em4和me12em8.基于UPGMA法聚类(GS=0.78)可将15个苦荞品种划分为3大类,但这3类划分的品种没有明显的地域分布特征.

关键词：苦荞、SRAP-PCR、正交试验设计、遗传多样性

所属期刊栏目：20

分类号：S517(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金NSFC:31301385;山西省青年科技研究基金2011021032-1,2011021032-3;山西农业大学科技创新育种基金2010028;高等学校科技创新项目2013115;山西省高校重点学科建设专项资金

在线出版日期：2015-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：37-43