Ⅰ型鸭肝炎病毒F株基因组测序及其结构分析

摘要：

通过鸭肝炎病毒F株的测序分析研究了鸭肝炎病毒基因组间的变异情况,为鸭肝炎病毒病的防治提供线索.结果表明DHV-F具有DHV-Ⅰ所具有的基本特征此外还有如下特点:1)DHV-F 5′UTR含有8个茎环结构,且有2个GNRA基序、A/C富含区、U/C富含区、A富含环和U富含环;2)2C蛋白基序DDLxQ中的亮氨酸被苯丙氨酸(192～196 aa)所替代;3)3D蛋白基序PSG中的脯氨酸被半胱氨酸(280～282 aa)所替代;4)预测表明3D蛋白具有"指、拇指和掌"的空间构象,且具有一个大的开放性的中间槽;5)3D蛋白所有保守基序位于蛋白亚基的内层;6)DHV-F的多聚蛋白P2和P3与DHV-Ⅰ的相应蛋白片段有较高的同源性,而与P1的同源性相对较低.说明鸭肝炎病毒DHV-F有抗原性变异.

关键词：鸭、DHV-F、基因组、测序、进化、变异

所属期刊栏目：13

分类号：Q78;S858.32;S852.65(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30471283

在线出版日期：2009-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：54-60