甜菜组蛋白去乙酰化酶(HDACs)基因家族鉴定及功能预测

摘要：

为了鉴定甜菜基因组中春化作用相关的组蛋白去乙酰化酶(HDACs).本研究利用HMMsearch和Blastp鉴定BvHDACs基因家族成员,并采用iqtree程序构建最大似然进化树.利用TBtools分析BvHDACs染色体定位、基因结构.通过转录组测序分析春化过程中BvHDACs表达模式.结果表明,甜菜共有16个的BvHDACs基因分别位于5条染色体.它们可分为RPD3/HDA1、SIR2、HD2三个亚家族,亚家族内各成员功能结构域高度相似.转录组测序表明多个RPD3/HDA1、SIR2和HD2成员在春化过程中发生显著变化.尤其是,BvHDT1和BvHDT2变化趋势与抽薹表型变化具有相关性.蛋白互作预测表明BvHDT1、BvHDT2具有与BvFLD、BvJMJ11、BvJMJ12等抽薹开花相关蛋白相互作用的潜力.综上,推测BvHDT1和BvHDT2可能参与甜菜春化作用.

关键词：甜菜、春化作用、组蛋白去乙酰化酶、基因家族、抽薹

所属期刊栏目：38

分类号：S566.3(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金;黑龙江省自然科学基金联合引导项目

在线出版日期：2022-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：9-16