绒毛白蜡smh1基因编码区的克隆及序列分析
为探究绒毛白蜡smh1端粒结合蛋白基因在端粒中的作用以及在植物生长发育过程中的调控机制,进行绒毛白蜡smh1端粒结合蛋白基因克隆及分析.以绒毛白蜡幼苗为试材,Illumina HiSeq 2000高通量测序技术获得的绒毛白蜡转录组Unigene数据为基础,采用RT-PCR方法克隆绒毛白蜡smh1基因编码区序列并进行生物信息学分析.结果表明:从绒毛白蜡叶片中成功克隆出一个smh类端粒结合蛋白基因编码区序列.基因编码区长度为879 bp,可编码292个氨基酸,分子量为31.66 kDa,等电点为6.5,原子总数为4457个,分子式为C1371H2242N392O439S13.Conserved Domains数据库对蛋白质的保守结构域进行分析,结果显示该蛋白序列具有植物端粒结合蛋白Smh (single myb histone)亚家族典型的结构特征,包括位于N-端的Myb样结构域以及中间的组蛋白H1/5样结构域.将FvSmh1端粒结合蛋白与含有telobox基序的其他端粒结合蛋白进行系统进化树的构建,结果显示SMH端粒结合蛋白与TRF1和TRF2同属一个分支,具有较近的关系.从上述分析结果可以推断所克隆的绒毛白蜡smh1基因可能对植物端粒结构的维持和功能的发挥具有重要作用.
绒毛白蜡、端粒、端粒结合蛋白、克隆、序列分析
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S722.5(造林学、林木育种及造林技术)
国家“十二五”科技支撑计划专题“白蜡种质资源发掘与创新利用”2013BAD01B06-6;山东省科技发展计划项目“白蜡种质资源分子评价与体胚发育技术研究”2014GNC111006
2017-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
49-55
