烟草Ⅰ型几丁质酶的生物信息学分析

摘要：

旨在对烟草Ⅰ型几丁质酶进行生物信息学分析,了解其生物学特征,为下一步研究烟草Ⅰ型几丁质酶在烟草抗病过程中的作用奠定基础.采用生物信息学的方法,对已在NCBI上登陆的烟草、拟南芥、水稻、菜豆的Ⅰ型几丁质酶(chitinase,Chi Ⅰ)氨基酸序列特征和进化关系进行了预测和分析.结果表明,这4种植物Ⅰ型几丁质酶的分子量大小在28～37 kDa之间,均具有信号肽,结构域高度保守,均具有几丁质结合区(Cht BD1)和催化功能区(Glyco_hydro_1 9);烟草中的3种Ⅰ型几丁质酶序列相似性较高,可以聚为一类;烟草与拟南芥和菜豆中的一种Chi Ⅰ遗传距离较近,而与水稻中Chi Ⅰ的遗传距离较远.通过分析发现,烟草Ⅰ型几丁质酶有着与其他植物中该酶相同的特性,为进一步研究烟草抗病蛋白提供理论依据.

关键词：烟草、Ⅰ型几丁质酶、生物信息学

所属期刊栏目：30

分类号：Q55(酶)

资助基金：中国烟草总公司科技重大专项项目“烟草抗CMV和赤星病连锁分子标记开发及NC82、K326品种抗性改良”110201301009.

在线出版日期：2015-01-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：95-99