小叶杨热激转录因子基因的克隆及单核苷酸多态性分析

摘要：

热激转录因子(heat shock transcription factor,HSF)在调节植物对逆境胁迫(特别是热胁迫)应答和相关基因表达方面起重要作用.笔者采用RT-PCR方法,首次从小叶杨基因组DNA中分离出热激转录因子基因,并进行测序和序列分析.结果表明:小叶杨HSF基因总长度为2884 bp,基因内部含有完整的编码阅读框架,即编码区为1398 bp,可编码466个氨基酸残基,所推导的蛋白质序列与拟南芥和葡萄HSF蛋白的同源性分别为63％和78％.组合利用MEGA3.1和DNASP4.0软件对小叶杨16株基因型个体的HSF序列进行比对和分析,共检测到107个SNP位点,多态性频率为1/27 bp,其中常见SNP为42个,罕见SNP为65个.在PsHSFB基因内部发生的单核苷酸变异中,71个属于转换,36个属于颠换.在外显子区域,共检测到52个SNP位点,其中15个为同义突变,37个为错义突变.本研究为小叶杨热激转录因子基因的连锁不平衡作图及其基因辅助小叶杨抗逆性状的分子育种提供重要的理论依据.

关键词：小叶杨、热激转录因子、基因克隆、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：28

分类号：S722.3+6(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家林业局948项目2008-4-21

在线出版日期：2013-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：20-26