3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析

摘要：

为分析3株1型鸭肝炎病毒(DHV)的遗传变异和进化关系;采用RT-PCR和5'-/3'-RACE.方法测定3株1型鸭肝炎病毒全基因序列;研究结果表明,不含poly(A)尾巴的3株病毒的基因组全长为7691～7700 nt,基因组均仅含一个长度为6750 nt的ORF,625～627 nt 5'端非翻译区和325～328 nt 3'端非翻译区(UTR).将3株病毒株与GeneBank公布的其他DHV-1全基因序列及小RNA病毒科的其他属代表病毒株进行序列分析表明,聚蛋白均被分割成为12个蛋白,其中VP1的变异性最大,180～187位为高变区.3株病毒与DHV-1参考毒株核苷酸序列同源性在93.7%～98.8%,氨基酸序列同源性在96.9%～98.8%,DHV-1各株在小RNA科病毒多聚蛋白氨基酸序列进化树上形成一个独立的进化分支;DHVs-1病毒间核苷酸和氨基酸仍较保守,它们在进化中可将其归为小RNA病毒科的一个新属.

关键词：鸭肝炎病毒1型、基因组、序列分析

所属期刊栏目：26

分类号：S852.65+9.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金"鸭肝炎病毒基因组结构研究"30471283

在线出版日期：2010-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：8-12