奶牛DRB3基因生物信息学分析

摘要：

利用生物基因组学数据库,对奶牛MHC Ⅱ区DRB3基因进行生物信息学分析,以预测DRB3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建DRB3同源基因的系统进化树.结果表明,DRB3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29～30位的氨基酸之间.二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主,主要在细胞质中发挥生物学作用.序列分析表明,DRB3编码产物可能具有免疫应答、受体、胁迫应答、信号转导等功能,可能在免疫应答和胁迫应答过程中发挥重要作用,可能对奶牛免疫力和抗病性起关键作用.DRB3编码产物氨基酸邻接系统树表明,奶牛DRB3与绵羊、羚羊、塔尔羊、麝牛、亚洲水牛等物种DRB3氨基酸距离较近,它们具有高度同源性.

关键词：主要组织相容性复合体、DRB3基因、生物信息学、奶牛

分类号：S823(家畜)

资助基金：国家高技术研究发展计划"863"计划项目2006AA10Z196;国家科技支撑计划项目2007BAD52B05;甘肃省农业生物技术专项GNSW-2009-24;甘肃省重点实验室建设计划项目085RTSA004

在线出版日期：2011-09-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：4-8