柑桔衰退病毒RB和VT基因型实时定量PCR检测方法建立和应用

摘要：

为定量检测样品中柑桔衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)RB和VT基因型含量,以RB基因型的p33基因、VT基因型的ORF1a基因为靶标,建立了RB和VT基因型的特异性实时定量PCR方法.该方法检测RB和VT基因型质粒浓度下限均为2×101 copies/μL,灵敏度为普通PCR的1 000倍;对RB和VT基因型进行检测,质粒拷贝数对数(x)与Ct值(y)的标准曲线方程分别为 y=-3.325 5x+37.845 3 和v=-3.273 7x+36.283 9,R2 分别为 0.999 1 和 0.995 4,扩增效率分别为99.85％和102.05％;方法的重复性良好,组内和组间Ct值变异系数均小于2.07％.对田间样品检测发现,不同样品之间RB基因型含量差异和VT基因型含量差异均较大.该方法特异性强,灵敏度高,适用于田间样品检测.

关键词：柑桔衰退病毒、RB基因型、VT基因型、实时定量RT-PCR

所属期刊栏目：53

分类号：S852.65;Q782;R123.1

资助基金：江西省教育厅科学技术研究项目;江西省科技项目;国家自然科学基金

在线出版日期：2024-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：18-24