中国李品种“秋姬”基因组Survey测序分析

摘要：

中国李是重要的落叶果树之一,具有较高的经济价值与生态价值,但其全基因组信息尚未被解析,限制了相关研究的深入开展.通过二代基因组Survey测序分析,对中国李品种“秋姬”全基因组信息进行初步解析,质控后共获得22.9 Gb高质量数据,经17-mer分析,预估其基因组大小为305.6Mb,基因组杂合度为0.92％,属于高杂合中型基因组;采用SOAPdenovo软件进行组装,所得Contig N50为440 bp,Scaffold总长约为267Mb.后续拟用第三代测序技术进行精细组装.

关键词：李、基因组、Survey测序

所属期刊栏目：49

资助基金：中国农业科学院科技创新工程专项经费;河南省重点研发与推广专项科技攻关;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项

在线出版日期：2020-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：102-104