香蕉α-淀粉酶基因家族的系统进化分析

摘要：

α-淀粉酶(Amy)是一类关键的淀粉水解酶,在香蕉果实成熟淀粉降解转化为可溶性糖的过程中发挥着重要作用.本研究基于香蕉基因组数据,通过生物信息学的方法对香蕉α-淀粉酶基因的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、内含子和外显子结构和保守结构域进行初步的预测与分析,并构建系统发育树.结果表明,编码香蕉α-淀粉酶的基因有12个,根据在染色体的位置命名为MaAmy1～12,MaAmy基因家族编码的氨基酸的范围在79～914个,编码的蛋白相对分子量介于8.8～103.2 kD之间,12个MaAmy蛋白中有8个偏酸性,3个偏碱性.不稳定指数分析发现,8个MaAmy蛋白为稳定蛋白;疏水性分析表明,所有的MaAmy蛋白为亲水性蛋白;香蕉MaAmy家族最多的含有13个内含子;进化分析表明,MaAmy家族分4个亚家族.

关键词：香蕉、α-淀粉酶、基因家族、系统进化分析

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资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务专项1630062014010;海南省自然科学基金20153134资助.

在线出版日期：2016-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：12-17,22