基于SSR标记的赣南柑桔黄龙病菌遗传多样性分析

摘要：

从已报道的韧皮部杆菌基因组的23个SSR位点中筛选出3个位点(LasSSR-C、LasSSR-D、CWBJ44),用于赣南14个县(区、市)的342份柑桔黄龙病菌样品的遗传多样性及各地种群结构的分析.结果表明,赣南地区柑桔黄龙病菌种群在LasSSR-C、LasSSR-D和CWBJ44位点的Nei's多样性指数H分别为0.734 6、0.576 2和0.291 3,赣州西南部县(区、市)的多样性指数H比东北部高;大余县的等位基因与其他县(区、市)区别较大.Powermarker软件UPGMA聚类分析将所有样品分为两个组群,大余县单独列为一个组群,其余县(区、市)聚为一个组群.Structure软件聚类分析也得出了相似的结果,大余县的种群构成较为单一,91.8％的样品属同一组群,而其他县(区、市)的种群则是由两个组群菌株按不同比例混合构成.

关键词：赣南、柑桔黄龙病菌、简单重复序列、种群结构

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资助基金：国家自然科学基金31560602;江西省科技计划重大项目20152ACF60003;江西省科技厅青年科学基金计划20133BAB21001;江西省自然科学基金20122BAB204024;江西省科技计划重大项目20161ACF60016;江西省科技计划重大项目20143ACF60012资助.

在线出版日期：2016-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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