基于微卫星技术的赣南脐橙溃疡病菌遗传多样性分析

摘要：

在赣南18个县(市、区)收集到508份柑桔溃疡病菌样品,采用已报道的柑桔溃疡病菌A菌系306菌株(GenBank Accession no.AE008923)基因组上的14个SSR位点分析遗传多样性.从14个SSR位点中,筛选出用于赣南地区溃疡病菌种群多样性研究的SSR位点7个(XL1、XL2、XL3、XL4、XL5、XL6和XL7),测试得到的Nei's基因多样性指数在0.66～0.83之间.通过这7个位点分析赣南不同地域的样品发现,大余县样品的遗传多态性最高,定南县样品的遗传多态性最低.采用Structure 3.25和PowerMarker 2.3.4软件聚类分析发现,赣南18县(市、区)的柑桔溃疡病菌样品分成两个组群,且某些县(区)群体结构构成单一.其中,信丰、定南和章贡区样品群体属于同一组群,兴国和会昌样品群体属于另一组群,其他县(区)样品群体则是由两个组群菌株按不同比例混合构成.

关键词：赣南、柑桔黄单胞菌柑桔亚种、遗传多样性、微卫星技术

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资助基金：农业部公益性行业农业科研专项201003067-02资助.

在线出版日期：2016-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：28-32,37