杧果TRAP标记反应体系的优化与引物筛选

摘要：

为了建立杧果目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响该反应体系的Mg2+、dNTPs、固定引物浓度、随机引物浓度以及Taq DNA聚合酶等5个因素进行优化.确定优化的反应体系总体积为15 μL,包括模板DNA 40 ng、1×buffer、Mg2+ 1.4 mmol/L、dNTPs 0.2 mmol/L、固定引物0.8 μmol/L、随机引物0.04 μmol/L、Taq酶1.7U.利用杧果公共数据库抗病基因相关序列设计锚定引物13条,与7条随机引物组合共91对引物.利用这些引物对杧果品种进行TRAP-PCR扩增,其中66个引物组合能扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性,占引物总量的72.53％.

关键词：杧果、TRAP、体系优化、引物筛选

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资助基金：广东省自然科学基金—博士启动项目2014A030310341;海南省自然科学基金20153044资助.

在线出版日期：2015-09-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：5-10