高良姜黄酮醇合成酶基因的生物信息学分析
在前期建立的转录组数据中注释获得高良姜黄酮醇合成酶(flavonol synthase,FLS)编码基因序列,通过生物信息学分析软件对该基因及其编码蛋白进行序列分析,探讨其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、高级结构、保守功能域以及系统发育关系,并运用fragments per kilobase of exon per million reads mapped(FPKM)法计算该基因在高良姜不同组织中的表达差异.获得的高良姜F.LS基因含有1005 bp的开放阅读框,编码含有334个氨基酸的蛋白质.编码蛋白的序列分析发现,高良姜FLS蛋白分子量约为38.2kDa,属于亲水性、混合结构型蛋白,不含有跨膜结构域并定位在细胞质;具有黄酮醇合成酶保守功能域.FLS基因在高良姜不同组织中的表达趋势为根茎＞茎＞叶片.上述结果可为后续利用该基因调控高良姜黄酮醇类成分的生物合成奠定基础.
高良姜、黄酮醇合成酶、生物信息学
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R284.1(中药学)
广东省中医药局中医药科研项目20211224
2023-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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