HMMR基因与肺腺癌患者预后及浸润性免疫细胞关系的生物信息学分析

摘要：

目的:透明质酸介导的运动受体(HMMR)基因在多种肿瘤中异常表达,然而,其在肺腺癌(LUAD)中的预后价值及与浸润性淋巴细胞的关系未知,因此,本文着重研究HMMR在LUAD中的预后价值及与浸润性免疫细胞的关系.方法:从TCGA数据库下载LUAD组织和正常组织间的转录表达谱及相应临床信息.通过RT-PCR反应评估LUAD细胞系及正常支气管上皮细胞系HMMR的表达水平.通过临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)评估HMMR蛋白表达情况.受试者工作特征(ROC)曲线用于区分LUAD组织与邻近正常组织.通过单因素及多因素Cox分析及Kaplan-Meier方法评估HMMR对患者预后的影响.通过STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.采用R语言"ClusterProfiler"包进行功能富集分析.通过TIMER评估HMMR在不同肿瘤中的表达情况及与LUAD浸润性免疫细胞浸润丰度间的关系.结果:HMMR在肺腺癌组织及细胞系中的表达较邻近正常组织或正常支气管上皮细胞系中显著上调.HMMR表达增加与吸烟超过40年、R1或R2残留肿瘤、高T分期、淋巴结转移、远处转移和高TNM分期相关.Kaplan-Meier生存分析显示,HMMR高表达组的LUAD患者预后较低表达组患者差(41.9个月 vs 59.9个月,P<0.001),各亚组分析也显示相似的结果.ROC曲线分析表明,在截断水平为2.103的情况下,HMMR区分LUAD与相邻对照的敏感性和特异性分别为98.3%和86.2%.相关分析表明,HMMR的表达水平与肿瘤浸润性免疫细胞的浸润丰度相关.结论:HMMR表达上调与LUAD预后不良和免疫浸润显著相关,可以作为LUAD预后不良的生物标志物及免疫治疗靶点.

关键词：HMMR、肺腺癌、生物标志物、预后、免疫浸润

所属期刊栏目：39

分类号：R392.1

资助基金：孝感市自然科学计划项目XGKJ2021010052

在线出版日期：2023-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1943-1949