前列腺癌骨转移关键基因的生物信息学分析

摘要：

目的:利用生物信息学技术探究前列腺癌骨转移发生发展的分子机制,为前列腺癌骨转移提供新的预防和治疗靶点.方法:从基因表达数据库(GEO)检索筛选得到包含20例前列腺癌骨转移样本和69例前列腺癌淋巴结转移样本的基因芯片数据集GSE74685.利用R语言Limma包对原始数据进行预处理并筛选差异表达基因(DEGs).通过基因功能注释在线工具DAVID对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析.利用STRING在线检索工具及Cytoscape软件构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并用MCODE和cytoHubba插件筛选重要模块和关键基因.通过HCMDB和GEPIA数据库验证关键基因的表达、生存预后以及诊断价值.结果:从GSE74685数据集中筛选出2 022个DEGs,包括842个上调基因和1 180个下调基因.GO功能富集分析显示DEGs主要在细胞外基质组织、胶原分解代谢过程、对机械刺激的反应、中性粒细胞趋化性的正调控方面富集;KEGG通路富集提示黏着斑、细胞外基质受体相互作用是DEGs富集的主要信号通路.通过PPI网络筛选得到11个关键基因,分别为EZH2、PLG、SRC、CAV1、CHD4、HIST2H2BE、KDM1A、POLR2E、VWF、APOE、THBS1.对11个关键基因的基因表达验证和生存分析发现APOE和EZH2与前列腺癌骨转移密切相关.结论:EZH2、APOE可能参与前列腺癌骨转移的发生发展,可以作为潜在的治疗靶点,为前列腺癌骨转移的预防和治疗提供新的研究方向.

关键词：前列腺癌骨转移、生物信息学、差异表达基因、治疗靶点

所属期刊栏目：39

分类号：R737.25(肿瘤学)

资助基金：河北省自然科学基金资助项目;河北省医学科学研究课题计划项目

在线出版日期：2023-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1885-1892