乳腺癌铁死亡相关lncRNA预后模型构建和功能探索

摘要：

目的:乳腺癌(BRCA)占女性恶性肿瘤榜首.铁死亡是铁依赖性程序性细胞死亡的一种形式,近年来成为肿瘤治疗的新策略.本研究旨在构建乳腺铁死亡相关lncRNA预后模型并进行功能探索.方法:从UCSC XENA数据库获取TCGA-BRCA的RNA-seq数据,获得BRCA组织中差异表达铁死亡相关基因,筛选BRCA组织中异常表达的lncRNAs.通过Spearman相关性分析筛选获得铁死亡相关lncRNAs,结合TCGA-BRCA临床数据进行单因素及多因素回归分析构建铁死亡相关lncRNAs预后风险模型.对高、低风险组进行GO和KEGG通路富集,探讨风险差异;通过ssGSEA分析高低风险组之间免疫活性的差异.最后,基于ceRNA假说构建铁死亡相关lncRNAs预后模型异常调控的lncRNA miRNA-mRNA网络.结果:通过单因素及多因素回归分析,最终获得5个铁死亡相关lncRNA预后模型,ROC曲线结果表明模型预测性能良好.GO富集分析和KEGG通路富集分析提示PI3K-Akt等信号通路存在差异;ssGSEA显示高低风险组免疫细胞及免疫相关途径存在差异.结论:lncRNA AC002546.1在BRCA的发生和发展中可能发挥重要作用,可用于BRCA的临床预后预测.

关键词：乳腺癌、铁死亡、预后模型、lncRNA AC002546.1

所属期刊栏目：39

分类号：R392.13

资助基金：辽宁省兴辽英才计划项目XLYC1802049

在线出版日期：2023-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1367-1373