基于miRNA-mRNA调控网络筛选与验证参与Graves病B细胞增殖的关键基因

摘要：

目的:利用生物信息学筛选出Graves病(GD)患者外周血B细胞中差异表达的miRNA,构建miRNA-mRNA调控网络,为GD治疗提供新靶点.方法:采用微阵列技术检测初发GD患者和健康受试者外周血CD19+B细胞中miRNA和mRNA表达谱.利用TargetScan和miRBase数据库对差异miRNA的靶基因进行预测,与差异mRNA取交集,筛选出目的靶基因.构建miRNA-mRNA差异表达网络,对其进行GO注释分析,筛选出与B细胞增殖相关的mRNA并采用荧光定量PCR(qRTPCR)以及流式细胞术(FACS)等手段进行验证.结果:GD患者外周血CD19+B细胞中有119个差异表达miRNA和572个差异表达mRNA,并筛选到159个潜在靶基因.通过构建miRNA-mRNA差异表达网络以及GO注释分析等手段,证实与B细胞增殖相关的CD79B在GD患者外周血CD19+B细胞中表达升高.qRT-PCR和FACS验证得出GD患者外周血CD19+B细胞中CD79BmRNA和蛋白水平均显著上调(P<0.01).对调控CD79B的miRNA富集并进行qRF-PCR验证,结果显示GD患者外周血CD19+B细胞中hsa-miR-146b-5p表达显著下调(P<0.001).利用TargetScan数据库预测发现CD79B mRNA的3'端非编码区存在潜在的hsa-miR-146b-5p结合位点.结论:GD患者外周血B细胞中hsa-miR-146b-5p的下调可能促进CD79B上调,引起B细胞活化与增殖.CD79B有望成为GD新的生物标志物和治疗的潜在靶点.

关键词：Graves病、B细胞、miRNA、CD79B、微阵列

所属期刊栏目：38

分类号：R581.1(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：上海市自然科学基金;上海市自然科学基金;上海市医学重点专科建设计划

在线出版日期：2023-02-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2770-2776