自噬相关长链非编码RNA在肝细胞癌中的功能分析及预后模型构建

摘要：

目的:筛选在肝细胞癌(HCC)中具有预后价值的核心自噬相关长链非编码RNA(lncRNA).方法:选择癌症基因组图谱数据库(TCGA)和人类自噬数据库(HADb)进行生物信息学分析.以多因素Cox回归,最小绝对收缩和选择算子(Lasso)回归构建风险评分模型.模型的特异度和敏感度由受试者工作特征曲线(ROC)评估.相关生物学功能由Metascape数据库和基因集富集分析(GSEA)鉴定.结果:共鉴定了10个关键lncRNAs并据此构建风险评分模型.生存分析显示高风险组患者总生存期显著低于低风险组(P<0.001).该模型在预测HCC患者一年、三年、五年生存率方面表现良好,曲线下面积分别是0.810、0.751、0.736.多因素Cox回归表明,该模型是HCC的独立预后因素(HR=3.666,P<0.001).结论:本研究鉴定了10个自噬相关lncRNAs,并以之构建了1个用于HCC的预后风险模型,有望成为潜在的治疗靶点和新的预测指标.

关键词：肝细胞癌、自噬、长链非编码RNA、计算生物学、预后

所属期刊栏目：38

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金81973840

在线出版日期：2022-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：975-981