柯萨奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息学分析

摘要：

目的：预测柯萨奇病毒A组6型（ Coxsackievirus A6，CVA6）的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法：应用Bioedit软件、SubLoc、TargetP和生物信息学资源门户ExPASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行分析。结果：CVA6 VP1为一亲水性蛋白，其相对分子量为33.6 kD，等电点为7.92，含有24个可能的磷酸化位点，没有信号肽、跨膜区和可能的脂酰化位点；其二级结构中以无规则卷曲居多，有48.52％的氨基酸残基暴露于溶液界面；该分子内存在多个潜在的线性B细胞表位，其中的155～165位氨基酸残基区域的抗原指数最高。结论：成功预测到CVA6 VP1的基本理化性质、结构功能特征及可能的线性B细胞表位，为该蛋白的进一步研究及疫苗和免疫诊断试剂的研制打下基础。

关键词：柯萨奇病毒A组6型、VP1蛋白、生物学信息、B细胞表位、理化性质

所属期刊栏目：32

分类号：R373.2+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金项目81460304；81360248;广西自然科学基金2015GXNSFDA139020;广西壮族自治区卫生厅科研课题Z2014298。

在线出版日期：2016-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：536-541