10.11853/j.issn.1003.8280.2023.01.003
贵州省不同地理株中华按蚊mtDNA-CO Ⅰ基因遗传多态性分析
目的 了解贵州省不同地理株中华按蚊种群线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mtDNA-CO Ⅰ)基因序列的多态性,探讨其遗传多样性、遗传分化和种群扩张情况以及遗传距离与地理距离及其相关关系等种群遗传特征.方法 于2017年7月—2018年8月采用灯诱法在贵州省东、西、南、北、中5个方位的12个采样点采集稻田周边的成蚊,经过形态学确认为中华按蚊后,用试剂盒法提取单只蚊虫DNA样本并对mtDNA-CO Ⅰ基因扩增后测序,测序结果用DNAStar 5.0软件进行拼接,在美国国立生物技术信息中心经BLAST比对进行蚊种的分子鉴定,对确认为中华按蚊mtDNA-CO Ⅰ的基因序列使用DnaSP 5.1软件分析其单倍型多样性、核苷酸多样性,并计算各种群间分化系数(Fst)和基因流(Nm)大小,进行中性检验,以明确各种群之间的分化程度和种群扩张情况.使用MEGA 7.1软件计算各种群间和种群内的遗传距离,判断种群之间的遗传变异程度;根据采样点经纬度计算种群间的地理距离,与对应的遗传距离进行相关性检验,以分析两者的相关关系.结果 经分子生物学鉴定,共获得贵州省12个地理株中华按蚊mtDNA-CO Ⅰ基因序列551条,长度为709 bp,其中,碱基(A+T)和(G+C)平均含量分别为68.57%和31.43%,709个位点中保守位点有586个,变异位点有123个,单态位点有189个,简约性信息位点有278个,无插入和缺失位点.551条序列共检出329种单倍型,单倍型多样性指数为0.992,核苷酸多样性为0.015 22以上,12个种群的Fst值在0.000 8~0.420 7,Nm值在0.086 1~75.239 2,中性检验统计值均为负值,种群内遗传距离范围在0.007 1~0.052 9,种群间的遗传距离范围在0.007 9~0.052 2,织金种群和都匀种群内遗传距离较其他种群大;遗传距离和地理距离之间无相关关系,不同种群之间可能存在一定的地理隔离,但种群之间遗传距离的大小与地理距离不相关.结论 贵州省不同地理株中华按蚊种群遗传多样性丰富,在历史上经历了区域性的种群扩张,可能存在一定程度的遗传分化和地理隔离,但在一定范围内种群间也有基因交流,呈现出交流与隔离并存的分布格局.
中华按蚊、线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因、多态性、种群遗传
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R384.1(医学寄生虫学)
贵州省科技厅基础平台建设黔科平台号;黔南州科技计划项目
2023-03-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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