基于16S rRNA高通量测序的现场中华按蚊及其孳生地水体菌群结构研究

摘要：

目的 了解现场中华按蚊与孳生地水体的细菌菌群组成,分析其间的差异性.方法 采集上海市嘉定现场的中华按蚊雌蚊,分为未吸血雌蚊(A)和饱血雌蚊(B)2组,以及孳生地水样(W),分别提取宏基因组DNA.应用Illumina Miseq高通量测序技术测定16S rDNA V4变异区.整理统计测得的序列数目和操作分类单元(OTUs),分析细菌菌群的组成和丰度、细菌群落的丰富度和多样性,以及菌群组成在群落间的变化率,并与其幼蚊(L)进行菌群结构的比较.结果 获得优质序列数和精简后OTUs数分别为129056和2622.5 (A)、171734和3324.5 (B)、225890.5和2997(W).精简后的OTUs隶属20个门,144个科,295个属.Chao1指数从高到低为B＞W＞A,辛普森指数为B＞W＞A,香农指数为A＞B＞W.分析细菌菌群丰度显示,A与B样本中优势菌均隶属变形菌门和厚壁菌门,丰度高的细菌为不动杆菌属(A,41.35％;B,25.71％)和泛菌属(A,10.58％;B,12.70％),B样本的Asaia丰度最高为40.85％.W样本中优势菌均隶属厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门,丰度＞10.00％的为Desulfosporosinus (24.19％)、弯杆菌属(19.48％)、产黄菌属(15.27％)、假单胞菌属(12.19％)和Alkalibacter(10.28％).各样本间细菌菌群差异的t检验结果显示,成蚊A与B样本间差异有统计学意义的门为1个,而W样本与幼蚊、成蚊之间为9个.主成分分析可见同组的样本间细菌多样性相近;热图聚类分析显示W与L聚为一支,B与A聚为另一支.结论 获得了现场中华按蚊雌蚊和孳生地稻田水体的细菌菌群组成,雌蚊共生的优势菌群为不动杆菌属、泛菌属和Asaia;W样本中的细菌与其中生活的幼蚊之间、雌蚊A与B样本间的细菌菌群相似程度高.

关键词：中华按蚊;细菌菌群;孳生地水样

所属期刊栏目：32

分类号：R384.1(医学寄生虫学)

资助基金：上海市自然科学基金;国家自然科学基金;后勤科研课题重大项目

在线出版日期：2021-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：533-540