粉尘螨长链脂肪酸转运蛋白基因克隆及序列分析

摘要：

目的 获得粉尘螨长链脂肪酸转运蛋白(long-chain fatty acid transport protein,FATP)编码基因及其分子特征.方法 根据粉尘螨转录组基因测序结果,获得FATP编码序列片段,据此设计引物,用反转录-聚合酶链式反应从粉尘螨总RNA中扩增全长基因片段,构建原核表达质粒pET28a(+)-FATP.成功获取FATP序列后,利用Expasy 、SingaIP 5.0、GOR4和TMpred等软件进行氨基酸序列结构和功能分析,最后利用Clustal Omega及MEGA-X软件进行同源性分析.结果 基因编码序列全长1 071 bp,编码的蛋白质由356个氨基酸组成,其亲水性指数为-0.39,此蛋白为可溶性蛋白,结构稳定,二级结构包括α-螺旋(25.56％)、延伸主链(23.04％)和无规则卷曲(51.40％).该蛋白存在两处较明显的跨膜区段,由外向内的跨膜区位于1 ～20位氨基酸,由内向外的跨膜区在100～116位氨基酸.同源氨基酸序列构建的分子进化树中发现与家蚕聚成一簇.结论 获得了粉尘螨FATP编码基因全长及其分子特征,为探讨粉尘螨生理现象、开发粉尘螨控制措施奠定基础.

关键词：粉尘螨、长链脂肪酸转运蛋白、分子克隆、生物信息学

所属期刊栏目：31

分类号：R384.4(医学寄生虫学)

资助基金：国家自然科学基金;无锡市卫生计生科研重大项目;江苏省第五期“333工程”科研项目;江苏省重点研发计划

在线出版日期：2020-05-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：169-174