云南省楚雄市2015-2018年肾综合征出血热流行特征及宿主动物调查

摘要：

目的 调查云南省楚雄市肾综合征出血热(HFRS)流行特征、鼠类分布及其携带汉坦病毒(HV)的分子进化特征.方法 收集HFRS病例资料,采用描述流行病学方法进行分析.用笼夜法捕鼠,计算鼠种构成比和鼠密度.鼠肺标本用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测HV核酸及L基因部分片段,并进行序列测定,使用ClastalX 1.83和MEGA 6.0等生物信息学软件进行HV同源性分析和构建系统进化树.结果 2015-2018年楚雄市共报告HFRS病例186例,年平均发病率为7.74/10万.楚雄市14个乡镇均有HFRS病例报告,其中鹿城和东瓜镇发病数占发病总数的75.27％(140/186),为主要流行区.全年各月均有病例发生,男女性别比例为2.1∶1,以青壮年和农民居多.2015-2018年的5-10月在楚雄市居住区共捕获鼠类3种1 053只,其中褐家鼠、黄胸鼠和斯氏家鼠的构成比依次为97.06％、1.80％和1.14％,鼠密度依次为2.57％、0.05％和0.03％,以鹿城和东瓜镇褐家鼠密度最高(3.09％).2016年在楚雄市采获的50只褐家鼠肺脏组织标本经RT-PCR检测,HV核酸阳性2份(CX04-06和CX07-09),带病毒率为4.00％.L基因部分序列同源性分析表明,CX04-06和CX07-09病毒株与8株HV汉城型病毒(SEOV)的核苷酸同源性为72.34％～93.52％,其中,与云南省祥云县DLR2株和老挝L0199株同源性最高(92.39％～93.52％),但仍存在明显差异;与汉滩型病毒和普马拉病毒的核苷酸同源性分别仅为69.54％～71.76％和51.19％～54.44％.系统进化分析表明,CX04-06和CX07-09株与来自云南省祥云县和老挝等地的SEOV参考株具有较近的亲缘关系.结论 楚雄市HFRS高发,褐家鼠为居民区室内优势鼠种并携带SEOV,流行株具有地域特征.楚雄市HFRS疫情上升与褐家鼠广泛分布及其种群密度增高密切相关.

关键词：肾综合征出血热、流行特征、啮齿动物、汉坦病毒、同源性分析、进化分析

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分类号：R373.3+2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划;全军青年培育项目

在线出版日期：2020-05-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：152-157,163