沈阳市鼠携带汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析

摘要：

目的 了解沈阳市肾综合征出血热(HFRS)疫源地宿主动物携带汉坦病毒(HV)的基因型别及变异情况.方法 选取沈阳市HFRS高发地区,于2017年春、秋两季分别在居民区和野外同时捕获宿主动物(鼠),并采集鼠肺.采用间接免疫荧光试验(IFA)筛选出HV抗原阳性的鼠肺,用RT-PCR从IFA筛选阳性的鼠肺中扩增G2基因片段.经琼脂糖凝胶电泳进行基因分型,对扩增产物进行核苷酸序列测定,用DNAStar软件进行同源性分析.结果 筛选出HFRS抗原阳性的鼠肺17份,对阳性鼠肺标本经RT-PCR检测,10份标本扩增出目的片段,均为HV汉城型(SEO).扩增产物测序结果与国内毒株及部分国际标准株比较,10份SEO型HV之间核苷酸同源性高达99.3％～100％.与80-39株(韩国,1980)同源性最高,为95.6％～96.2％,推导氨基酸同源性为99.3％.结论 沈阳市HFRS鼠间疫情的HV基因型以SEO型为主,检测出的鼠间HV G2基因片段之间高度同源,无明显变异,遗传物质相对稳定.

关键词：汉坦病毒、鼠肺、G2片段、系统进化树

所属期刊栏目：30

分类号：R373.3+2;R34(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2019-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：91-94