滇西南地区埃及伊蚊种群微卫星标记筛选研究

摘要：

目的 研究滇西南地区埃及伊蚊种群遗传学特征,针对该地区的埃及伊蚊种群筛选新的微卫星位点.方法 从美国国立生物技术信息中心GenBank数据库中下载埃及伊蚊全基因组数据,利用Tandem Repeats Finder软件查找全基因组中的微卫星位点,选择重复单位为2～4 bp且重复次数<30的微卫星位点,对其侧链进行BLAST比对,选择在基因组中单拷贝的位点设计引物,再对引物进行BLAST比对,选择扩增产物为单拷贝的引物进行相关筛选.结果 从17个全基因组中共获得80条微卫星序列,并成功设计出11对多态性引物,核心序列包括5对2碱基重复,5对3碱基重复以及1对4碱基重复,共有98个等位基因,平均每对引物有9个等位基因,观察杂合度平均值为(0.394±0.026).结论 设计引物可稳定地扩增出目标条带,且多态性较高,可以用于埃及伊蚊的种群遗传学研究.

关键词：埃及伊蚊、微卫星、引物

所属期刊栏目：29

分类号：R384.1(医学寄生虫学)

资助基金：国家重点研发计划2016YFC1200503,2016YFC1200802

在线出版日期：2018-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：130-133