二代测序技术检测不同环境下美洲大蠊 携带细菌的研究

摘要：

目的 研究二代测序技术(NGS)在美洲大蠊携带细菌检测中的应用,建立一种可检测美洲大蠊体内、体表所携带未知种类细菌的方法,分析不同环境下美洲大蠊携带细菌情况及其与环境的关系.方法 2016年8-9月,以中山地区居民区、港口和医院环境中捕获的美洲大蠊为材料,对其16S rDNA V1~V9可变区分析,选取V3~V4可变区作为目的基因,利用NGS对其携带的细菌种类进行检测和分析.结果 港口、居民区和医院采集的美洲大蠊分别携带1564、1786和1779个运算分类单位;利用NGS分别可鉴定出细菌123属36种、131属42种和136属48种,细菌种类数超过传统方法.通过对样品进行物种多样性和聚类分析发现,同一环境下的样本无法完全聚集在一起.结论 16S rDNA V3~V4可变区适合对美洲大蠊体内、体表携带的细菌进行检测,利用NGS可一次性检出多种细菌;其检出的细菌种类远超出传统方法且操作简便;美洲大蠊携带细菌的种类与其生存环境无明显的区域特异性.

关键词：二代测序技术、美洲大蠊、细菌

所属期刊栏目：28

分类号：R384.9;R37(医学寄生虫学)

资助基金：国家质量基础项目2016YFF0203205;广东省国际合作项目2015A050502009;the National Quality Infrastructure Program2016YFF0203205;Guangdong Province International Cooperation Project2015A050502009

在线出版日期：2017-12-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：543-549