鼠疫菌3种常见质粒的结构特征分析

摘要：

目的 研究鼠疫菌基因组中3种常见质粒的基因构成和分布特征.方法 应用编码基因序列相似性比对和生物信息学软件自动分析2种方法,分别对国际上已完成全基因组测序的9株鼠疫菌的鼠毒素质粒(pMT1)、低钙反应质粒(pCD1)和鼠疫菌素质粒(pPCP1)进行整体结构的比较分析.结果 pMT1质粒上存在基因大片段的重新排列,整条质粒被划分成4个主要的基因模块.CO92、KIM和91001菌株分属于东方型、中世纪型和田鼠型3个不同的生物型,他们的pMT1质粒结构各有特点;Nepal 516等其余6株菌均是古典型鼠疫菌,他们的pMT1质粒结构基本一致,且与其他3个生物型鼠疫菌株的pMT1质粒结构不同.pCD1质粒被划分成3个主要的基因模块,但整体结构在不同菌株中并无差异,只有IS100在质粒中的插入位置各不相同.pPCP1质粒上所有编码基因的排列顺序和方向在各菌株中完全相同.结论 鼠疫菌pCD1和pPCP1质粒的基因结构比较稳定,而pMT1质粒结构在鼠疫菌的长期进化过程中发生了一定程度的变异.

关键词：鼠疫耶尔森菌、质粒、结构

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分类号：R254.8(中医内科)

资助基金：卫生行业科研专项项目201202021;Supported by the Special Fund for Health Sector,People's Republic of China No.201202021

在线出版日期：2015-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：33-36,40