海南省澄迈县斑点热群立克次体分离株多间隔序列分型

摘要：

目的 采用多间隔序列分型(MST)对从海南省澄迈县发热患者及野鼠分离的62株斑点热群立克次体进行分型研究.方法 根据文献检索,应用9对成功用于斑点热群立克次体MST分型引物,对实验62株菌进行PCR扩增及测序.校正后序列进行Blast分析.同时,对序列进行Megalign比对分析单核苷酸多态性(SNPs).将每株细菌成功测序的6段间隔序列按一定顺序拼接并构建进化树.结果 使用6对间隔序列引物扩增实验菌株,结果显示每对引物扩增序列均显示较大的变异性,共获得48个变异型,以h3为代表的主要变异型占21.7％(13/60),剩余的47个变异型为独立型,分别占1.6％.进化树分析结果显示48个变异型均归为一簇.同其他参考菌株比较发现,黑龙江立克次体与上述菌株关系密切.SNPs分析发现位点变异主要以T-C转换及A-G转换为主.结论 海南地区斑点热群立克次体分离株非编码间隔序列呈高度变异性.MST分型较传统的血清表型分型以及MLST分型更具有鉴别能力,对未来立克次体暴发流行可提供快速有效的流行株追踪.

关键词：斑点热群立克次体、多间隔序列分型、海南省澄迈县

所属期刊栏目：25

分类号：R376(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2014-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：289-293