可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用

摘要：

目的 评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用.方法 采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析.结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个基因型,其中21个独立基因型,成簇率达24/31,MLVA的分辨率达到0.969；MLSA可将31株伯氏疏螺旋体分成4簇,每株都可独立分析,但有3个节点步长值(Bootstrap value) ＜50％.结论 MLVA和MLSA两种方法均适合于伯氏疏螺旋体的分型研究,对于部分分型有异议的菌株,将MLVA与MLSA联合可有效进行伯氏疏螺旋体的分型鉴定.

关键词：多位点序列分析、多位点可变数目串联重复序列分析、伯氏疏螺旋体、基因分型

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分类号：R377(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金31100105;国家科技重大专项课题2013ZX10004-001

在线出版日期：2013-08-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：98-102