鼠疫耶尔森菌基因组核糖体结合部位识别

摘要：

目的 通过统计分析鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)CO92株中核糖体结合位点(RBS)与翻译起始位点的距离,探索最适合翻译起始的RBS与起始位点的距离.方法 通过对鼠疫菌所有拷贝的16S rRNA 3’端,及已经通过实验确定的177处RBS进行分析,确定鼠疫菌RBS的序列特征.统计鼠疫菌CO92株中存在的所有RBS序列的位置和数量,及RBS序列与翻译起始序列ATG(GTG,TTG,CTG)的距离.观察已经公布的CO92株的编码序列(CDS)片段前20个碱基序列的特征.结果 在CO92的全基因组序列中搜索,共发现可能的RBS结构5081个,2909个后面一段距离内存在开放读码框架,其中1541与标注的CDS相符,535与标注的CDS终止位点相同,但起始位点不同.CO92序列中的3887 CDS前面20个碱基中,57.7％含有RBS序列.结论 RBS序列与起始位点间隔7个碱基和8个碱基出现的次数最多;RBS可能作为基因识别的重要指征.

关键词：核糖体结合位点、翻译起始、鼠疫耶尔森菌

所属期刊栏目：23

分类号：R254.8(中医内科)

资助基金：国家科技重大专项课题2008ZX10004-001;卫生行业科研专项鼠疫流行病学新技术研究与应用201202021

在线出版日期：2013-03-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：503-505,511