鼠疫菌全基因组单核苷酸多态性研究进展

摘要：

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,包括同义SNPs(synonymous SNPs,sSNPs)和非同义SNPs(non-synonymous SNPs,nSNPs).随着测序技术的迅速发展,获得了大量细菌全基因组序列,使得通过测序技术及生物信息学方法寻找潜在的SNPs位点成为可能.并且,由于SNPs本身的特性,使其作为一种新的分子标记,在细菌分型与进化、流行病学调查研究中得到广泛应用.该文主要阐述基于全基因组寻找SNPs位点,并建立以SNPs数据为基础的鼠疫菌微进化研究分析的研究进展状况.

关键词：鼠疫菌、全基因组、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：22

分类号：R378.6+1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家科技重大专项课题2008ZX10004-008

在线出版日期：2011-06-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：190-193