陆地棉GhDHN1基因结构及内含子生物信息学分析

摘要：

利用生物信息学方法分析陆地棉脱水素基因GhDHN1的DNA序列结构特性,预测其功能.序列分析表明,GhDHN1基因的基因组DNA中AT碱基含量为52.16％,而内含子具有较高的AT碱基含量(63.33％);GhDHN1基因不合CpG岛;其内含子序列含有核心启动子元件TATA框、启动子的增强子元件CAAT框,并含有参与光响应的保守DNA模块的部分元件(Box4)、赤霉素响应元件GARE-motif、生长素响应元件TGA元件等,说明该内含子可能参与了该基因的转录活动,可能受光、激素的诱导;GhDHN1内含子具有GT-AG规则的保守序列,推测GhDHN1基因具有保守的内含子剪接机制.

关键词：陆地棉、脱水素基因GhDHN1、基因结构、内含子、生物信息学分析

所属期刊栏目：45

分类号：S562.034(经济作物)

资助基金：国家重点研发计划“七大农作物育种”2016YFD0100203

在线出版日期：2018-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共2页

页码：10-11